在實際操作中，偏正顯微鏡的上下偏振鏡的振動方向要互相正交，或東西和南北方向，各自與目鏡十字絲的橫、縱向一致。有時只用一個下偏振鏡來觀測，必須確定下偏振鏡的振動方向，因此操作時必須對偏振鏡進行校正。