除了常規顯微技術中應用濾光片外，在熒光顯微鏡技術中使用一些特殊濾光片。如寬頻譜通透激發濾光片，高性能窄頻譜激發濾光片，高性能寬頻譜最強激發濾光片 即干涉濾光片，阻擋濾光片，色光分離濾光片等。這些濾光片的吸收曲線和使用方法可在熒光顯微鏡專章中介紹。還有更特殊的1/2波長波晶片，1/4波長波晶 片以及各種干涉片將在偏振光顯微鏡和干涉顯微鏡專章中講述。

這些濾光片在條件困難的情況下可用液體濾光器替代，也可以自制.具體細節將在本章附錄中介紹。

       1.日光型濾光片當使用人工光源時視野變黃色。染色標本的紅染、黃染細節不易分辨。利用淺藍色209號濾光片可把人工光源改變成近似自然光。普通顯微鏡所附的淺藍色玻片就是屬于此種濾光片。 

       2. 綠色濾光片當觀察標本上的紅色細節時使用綠色濾光片可增加標本細節的反差即對比度。在黑白底片上進行顯微照像時更為重要。因為一般全色膠片對藍、綠光特別 敏感，而對紅光遲鈍。蘇木紫一伊紅染色標本不加綠色濾光片時底片過于明亮。用綠色濾光片時標本細節的藍色被吸收而顯出很自然的物像。所以在進行黑白底片上 的顯微照像時，濾光片系列通透曲線510-590nm濾光片為佳。 

       3.黃綠色濾光片吸收率較高的黃綠色濾光片對培養細胞之類反差低的未染標本的觀察非常重要. 

       4.黃色濾光片中的510nm的濾光片對活細胞的觀察也是很好的。顯微R像時反差過大，物像細節照不清時用黃色濾光片能夠適宜地顯示標本的藍色細節。 

       5.藍色濾光片中的濾光片通透430-480nm,最好用于觀察黃色、綠色受染標本及其顯微照像。 

       6.吸熱濾光片較早時期為防止紅外線的熱輻射損傷光具組而使用液體吸熱濾光裝置。現代大型顯微鏡的照明光源具組中裝有可以擺進光路，也可擺出的吸熱玻璃濾光片。